Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NDUFS4O43181 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NDUFS4O43181 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NDUFS4O43181 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NDUFS4O43181 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NDUFS4O43181 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NDUFS4O43181 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NDUFS4O43181 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NDUFS4O43181 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms