Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBDO15205 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBDO15205 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBDO15205 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UBDO15205 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBDO15205 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBDO15205 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBDO15205 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBDO15205 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBDO15205 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBDO15205 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBDO15205 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBDO15205 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBDO15205 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBDO15205 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBDO15205 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBDO15205 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBDO15205 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBDO15205 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBDO15205 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBDO15205 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBDO15205 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
UBDO15205 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBDO15205 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBDO15205 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBDO15205 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBDO15205 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBDO15205 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
UBDO15205 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBDO15205 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBDO15205 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBDO15205 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBDO15205 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBDO15205 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBDO15205 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBDO15205 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBDO15205 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
UBDO15205 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBDO15205 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBDO15205 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBDO15205 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBDO15205 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBDO15205 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBDO15205 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBDO15205 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBDO15205 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms