Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLGNO14967 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLGNO14967 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLGNO14967 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLGNO14967 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLGNO14967 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLGNO14967 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLGNO14967 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLGNO14967 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLGNO14967 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLGNO14967 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLGNO14967 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLGNO14967 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLGNO14967 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLGNO14967 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLGNO14967 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLGNO14967 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLGNO14967 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLGNO14967 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLGNO14967 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLGNO14967 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLGNO14967 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLGNO14967 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLGNO14967 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLGNO14967 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLGNO14967 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLGNO14967 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLGNO14967 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLGNO14967 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLGNO14967 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLGNO14967 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLGNO14967 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLGNO14967 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLGNO14967 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLGNO14967 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLGNO14967 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLGNO14967 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLGNO14967 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLGNO14967 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLGNO14967 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLGNO14967 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLGNO14967 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms