Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHE40O14503 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms