Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4E171 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
B4E171 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4E171 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
B4E171 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4E171 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
B4E171 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4E171 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4E171 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4E171 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4E171 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4E171 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4E171 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
B4E171 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4E171 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4E171 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4E171 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4E171 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4E171 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B4E171 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
B4E171 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
B4E171 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
B4E171 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
B4E171 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
B4E171 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4E171 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4E171 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4E171 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4E171 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4E171 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4E171 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4E171 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4E171 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4E171 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
B4E171 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4E171 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
B4E171 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4E171 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4E171 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4E171 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4E171 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4E171 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4E171 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4E171 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4E171 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4E171 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4E171 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4E171 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4E171 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4E171 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4E171 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4E171 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4E171 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4E171 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4E171 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4E171 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4E171 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4E171 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4E171 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4E171 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4E171 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4E171 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4E171 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4E171 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4E171 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
B4E171 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4E171 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4E171 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4E171 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4E171 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4E171 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4E171 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4E171 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
B4E171 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4E171 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4E171 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4E171 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4E171 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
B4E171 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4E171 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4E171 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4E171 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4E171 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4E171 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4E171 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4E171 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4E171 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4E171 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4E171 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4E171 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4E171 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4E171 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4E171 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4E171 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4E171 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4E171 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4E171 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4E171 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
B4E171 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4E171 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms