Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ISM1B1AKI9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ISM1B1AKI9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ISM1B1AKI9 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ISM1B1AKI9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ISM1B1AKI9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ISM1B1AKI9 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ISM1B1AKI9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ISM1B1AKI9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ISM1B1AKI9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ISM1B1AKI9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ISM1B1AKI9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ISM1B1AKI9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ISM1B1AKI9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ISM1B1AKI9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ISM1B1AKI9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ISM1B1AKI9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ISM1B1AKI9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ISM1B1AKI9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ISM1B1AKI9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ISM1B1AKI9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ISM1B1AKI9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms