Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC78A2IDD5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms