Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYVE1Q9Y5Y7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms