Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms