Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF330Q9Y3S2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms