Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E8

SLC9A8, Sodium/hydrogen exchanger 8, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A8Q9Y2E8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A8Q9Y2E8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A8Q9Y2E8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A8Q9Y2E8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A8Q9Y2E8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A8Q9Y2E8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A8Q9Y2E8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC9A8Q9Y2E8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC9A8Q9Y2E8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms