Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZNF608Q9ULD9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNF608Q9ULD9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNF608Q9ULD9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNF608Q9ULD9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNF608Q9ULD9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF608Q9ULD9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF608Q9ULD9 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF608Q9ULD9 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF608Q9ULD9 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF608Q9ULD9 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF608Q9ULD9 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF608Q9ULD9 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF608Q9ULD9 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF608Q9ULD9 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF608Q9ULD9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF608Q9ULD9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF608Q9ULD9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF608Q9ULD9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF608Q9ULD9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF608Q9ULD9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF608Q9ULD9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF608Q9ULD9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF608Q9ULD9 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF608Q9ULD9 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF608Q9ULD9 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms