Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms