Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MID2Q9UJV3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms