Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA9Q9UGM1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms