Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL42Q9P2K6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms