Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRBP1Q9P2E9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRBP1Q9P2E9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms