Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COMMD8Q9NX08 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms