Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GINM1Q9NU53 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms