Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms