Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCC13Q9NSE7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms