Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLCO1B3Q9NPD5 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms