Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELL3Q9HB65 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELL3Q9HB65 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms