Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW11

MXD3, Max dimerization protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXD3Q9BW11 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MXD3Q9BW11 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MXD3Q9BW11 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MXD3Q9BW11 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MXD3Q9BW11 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MXD3Q9BW11 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MXD3Q9BW11 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MXD3Q9BW11 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MXD3Q9BW11 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MXD3Q9BW11 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MXD3Q9BW11 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MXD3Q9BW11 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MXD3Q9BW11 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MXD3Q9BW11 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MXD3Q9BW11 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MXD3Q9BW11 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MXD3Q9BW11 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MXD3Q9BW11 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MXD3Q9BW11 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MXD3Q9BW11 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MXD3Q9BW11 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MXD3Q9BW11 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MXD3Q9BW11 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MXD3Q9BW11 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms