Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9orf16Q9BUW7 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf16Q9BUW7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms