Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SEC22CQ9BRL7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SEC22CQ9BRL7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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SEC22CQ9BRL7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SEC22CQ9BRL7 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SEC22CQ9BRL7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SEC22CQ9BRL7 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SEC22CQ9BRL7 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SEC22CQ9BRL7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC22CQ9BRL7 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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