Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms