Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCK3Q9BQ16 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms