Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYD88Q99836 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms