Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms