Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPNQ96H22 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms