Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms