Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ19

KCTD13, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD13Q8WZ19 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCTD13Q8WZ19 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.4 ms