Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC12Q8WUD4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms