Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNX29Q8TEQ0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms