Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BEST4Q8NFU0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms