Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOT1Q8IXI2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms