Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PREX2Q70Z35 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms