Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CEP170Q5SW79 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms