Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFHC1Q5JVL4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms