Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDK2Q58EX2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms