Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6CQ53S08 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms