Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA8Q53HL2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms