Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

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Length 65 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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