Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PROX2Q3B8N5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms