Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HFEQ30201 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HFEQ30201 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HFEQ30201 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HFEQ30201 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HFEQ30201 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HFEQ30201 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HFEQ30201 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HFEQ30201 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HFEQ30201 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HFEQ30201 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HFEQ30201 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HFEQ30201 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HFEQ30201 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HFEQ30201 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HFEQ30201 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HFEQ30201 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HFEQ30201 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HFEQ30201 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HFEQ30201 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HFEQ30201 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HFEQ30201 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HFEQ30201 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HFEQ30201 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HFEQ30201 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HFEQ30201 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HFEQ30201 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HFEQ30201 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HFEQ30201 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HFEQ30201 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HFEQ30201 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HFEQ30201 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HFEQ30201 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HFEQ30201 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HFEQ30201 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HFEQ30201 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HFEQ30201 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HFEQ30201 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HFEQ30201 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HFEQ30201 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HFEQ30201 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HFEQ30201 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HFEQ30201 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HFEQ30201 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HFEQ30201 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms