Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SPHKAPQ2M3C7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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