Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF4Q2M2E3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms