Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KNOP1Q1ED39 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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