Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDO1Q16878 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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